Acerca de este Curso
5.0
12 calificaciones
4 revisiones
100 % en línea

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Comienza de inmediato y aprende a tu propio ritmo.
Fechas límite flexibles

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Restablece las fechas límite en función de tus horarios.
Nivel intermedio

Nivel intermedio

Horas para completar

Aprox. 14 horas para completar

Sugerido: 4-5 hours/week...
Idiomas disponibles

Inglés (English)

Subtítulos: Inglés (English)...
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Programa - Qué aprenderás en este curso

Semana
1
Horas para completar
2 horas para completar

The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

This module provides an overview of the concept behind the LINCS program; and tutorials on how to get started with using the LINCS L1000 dataset....
Reading
8 videos (Total: 78 min), 2 readings
Video8 videos
The Connectivity Map8m
Geometrical View of the Connectivity Map Concept3m
LINCS Data and Signature Generation Centers12m
BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center4m
Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)4m
Introduction to LINCS L1000 Data22m
L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo13m
Reading2 lecturas
Syllabus10m
Grading and Logistics10m
Horas para completar
26 minutos para completar

Metadata and Ontologies

This module includes a broad high level description of the concepts behind metadata and ontologies and how these are applied to LINCS datasets....
Reading
2 videos (Total: 26 min)
Video2 videos
Introduction to Metadata and Ontologies | Part 220m
Horas para completar
24 minutos para completar

Serving Data with APIs

In this module we explain the concept of accessing data through an application programming interface (API)....
Reading
2 videos (Total: 19 min)
Video2 videos
Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 210m
Semana
2
Horas para completar
19 minutos para completar

Bioinformatics Pipelines

This module describes the important concept of a Bioinformatics pipeline....
Reading
1 video (Total: 14 min)
Horas para completar
1 hora para completar

The Harmonizome

This module describes a project that integrates many resources that contain knowledge about genes and proteins. The project is called the Harmonizome, and it is implemented as a web-server application available at: http://amp.pharm.mssm.edu/Harmonizome/ ...
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4 videos (Total: 37 min)
Video4 videos
Processing Datasets | Part 18m
Processing Datasets | Part 29m
Processing Datasets | Part 37m
Semana
3
Horas para completar
24 minutos para completar

Data Normalization

This module describes the mathematical concepts behind data normalization....
Reading
2 videos (Total: 19 min)
Video2 videos
Data Normalization | Part 213m
Horas para completar
1 hora para completar

Data Clustering

This module describes the mathematical concepts behind data clustering, or in other words unsupervised learning - the identification of patterns within data without considering the labels associated with the data. ...
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3 videos (Total: 33 min)
Video3 videos
Data Clustering | Part 2 | Distance Functions 12m
Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation15m
Horas para completar
2 horas para completar

Midterm Exam

The Midterm Exam consists of 45 multiple choice questions which covers modules 1-7. Some of the questions may require you to perform some analysis with the methods you learned throughout the course on new datasets. ...
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1 quiz
Quiz1 ejercicio de práctica
Midterm Exam30m
Semana
4
Horas para completar
29 minutos para completar

Enrichment Analysis

This module introduces the important concept of performing gene set enrichment analyses. Enrichment analysis is the process of querying gene sets from genomics and proteomics studies against annotated gene sets collected from prior biological knowledge....
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3 videos (Total: 29 min)
Video3 videos
Enrichment Analysis | Part 27m
Enrichr Demo9m
Horas para completar
1 hora para completar

Machine Learning

This module describes the mathematical concepts of supervised machine learning, the process of making predictions from examples that associate observations/features/attribute with one or more properties that we wish to learn/predict....
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3 videos (Total: 27 min)
Video3 videos
Introduction to Machine Learning | Part 2 8m
Introduction to Machine Learning | Part 39m

Instructor

Avatar

Avi Ma’ayan, PhD

Director, Mount Sinai Center for Bioinformatics
Professor, Department of Pharmacological Sciences

Acerca de Icahn School of Medicine at Mount Sinai

The Icahn School of Medicine at Mount Sinai, in New York City is a leader in medical and scientific training and education, biomedical research and patient care....

Preguntas Frecuentes

  • Una vez que te inscribes para obtener un Certificado, tendrás acceso a todos los videos, cuestionarios y tareas de programación (si corresponde). Las tareas calificadas por compañeros solo pueden enviarse y revisarse una vez que haya comenzado tu sesión. Si eliges explorar el curso sin comprarlo, es posible que no puedas acceder a determinadas tareas.

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