Access Bioinformatics Databases with Biopython

ofrecido por
Coursera Project Network
En este Proyecto guiado, tú:

Sequence alignment using NCBI-BLAST

Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY

Access KEGG pathways and genes

Clock1 hour
IntermediateIntermedio
CloudNo se necesita descarga
VideoVideo de pantalla dividida
Comment DotsInglés (English)
LaptopSolo escritorio

In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython. You will also interact with various bioinformatics file formats such as FASTA, PDB, GENBANK and XML along with various parsers to read and modify these files using Biopython. Note: This course works best for learners who are based in the North America region. We’re currently working on providing the same experience in other regions.

Habilidades que desarrollarás

BioinformaticsPython Programmingaccess biological database

Aprende paso a paso

En un video que se reproduce en una pantalla dividida con tu área de trabajo, tu instructor te guiará en cada paso:

  1. Sequence alignment using NCBI-BLAST

  2. Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ

  3. Fetch proteins from PDB

  4. PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY

  5. Access KEGG database

Cómo funcionan los proyectos guiados

Tu espacio de trabajo es un escritorio virtual directamente en tu navegador, no requiere descarga.

En un video de pantalla dividida, tu instructor te guía paso a paso

Preguntas Frecuentes

Preguntas Frecuentes

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