فهم أهمية واستخدام المجموعات الهرمية باستخدام ملفات تخصيص الانحراف.
تحدد موقع ملفات الجينوم الفيروسي (cDNA) ومعالجتها لحساب ملفات تعريف الانحراف.
فهم نظرية استخدام معادلة فيثاغورس لحساب المسافة الإقليدية. وتطبيق ذلك باستخدام بايثون لبناء مصفوفة ربط.
بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.
Python Programming
Genomics
plotting
En un video que se reproduce en una pantalla dividida con tu área de trabajo, tu instructor te guiará en cada paso:
الخطوة الأولى: مقدمة (توسيع تحليل الانحراف)
الخطوة الثانية: تحديد موقع ملفات البيانات ومعالجتها
الخطوة الثالثة: استيعاب البيانات. فهم مجموعة البيانات الناتجة والتعامل معها
الخطوة الرابعة: التجميع الهرمي - (المقياس - Metric)
الخطوة الخامسة: التجميع الهرمي - (الترتيب والطرق Ordering & Methods)
الخطوة الساسدسة: رسم المخطط الشجري (dendrogram)
الخطوة السابعة: تحليل المخطط الشجري (dendrogram)
الخطوة الثامنة: أخطاء يجب تجنبها
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En un video de pantalla dividida, tu instructor te guía paso a paso
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