How do we infer which genes orchestrate various processes in the cell? How did humans migrate out of Africa and spread around the world? In this class, we will see that these two seemingly different questions can be addressed using similar algorithmic and machine learning techniques arising from the general problem of dividing data points into distinct clusters.
Este curso forma parte de Programa Especializado - Bioinformática
ofrecido por
Programa Especializado - BioinformáticaUniversidad de California en San DiegoAcerca de este Curso
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Resultados profesionales del estudiante
33%
consiguió un beneficio tangible en su carrera profesional gracias a este curso
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Nivel principiante
Aprox. 10 horas para completar
Inglés (English)
Subtítulos: Francés (French), Portugués (de Brasil), Ruso (Russian), Inglés (English), Español (Spanish)
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Universidad de California en San Diego
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Programa - Qué aprenderás en este curso
5 horas para completar
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for <strong>clustering </strong>a set of data points will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>
5 horas para completar
5 videos (Total 33 minutos), 2 lecturas, 3 cuestionarios
5 videos
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6m
Gene Expression Matrices 6m
Clustering as an Optimization Problem 10m
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5m
2 lecturas
Course Details10m
Week 1 FAQs (Optional)
1 ejercicio de práctica
Week 1 Quiz20m
4 horas para completar
Week 2: Advanced Clustering Techniques
<p>Welcome to week 2 of class!</p>
4 horas para completar
5 videos (Total 35 minutos), 1 lectura, 3 cuestionarios
5 videos
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4m
Expectation Maximization 7m
Soft k-Means Clustering 3m
Hierarchical Clustering 7m
1 lectura
Week 2 FAQs (Optional)
1 ejercicio de práctica
Week 2 Quiz15m
1 hora para completar
Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics
1 hora para completar
2 lecturas
2 lecturas
Statement on This Week's Material10m
How Have Humans Populated the Earth?10m
1 ejercicio de práctica
Week 3 Quiz30m
Reseñas
Principales reseñas sobre GENOMIC DATA SCIENCE AND CLUSTERING (BIOINFORMATICS V)
por DD23 de oct. de 2019
Truly awesome. What I liked best was that this course didn't have a peer reviewed final challenge, so I didn't have to wait months until my work was graded :)
por QW21 de may. de 2017
The first two week was very good, but for week 3 I don't see the content has any connection with Genomic Data Science.
por MK14 de may. de 2020
Very interesting course! So inspiring :) Recommend for everyone who interested in bioinformatic
por JM21 de mar. de 2020
Really enjoyed the clustering chapters and the practical exercises with the yeast dataset
Acerca de Programa especializado: Bioinformática
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Preguntas Frecuentes
¿Cuándo podré acceder a las lecciones y tareas?
El acceso a las clases y las asignaciones depende del tipo de inscripción que tengas. Si tomas un curso en modo de oyente, verás la mayoría de los materiales del curso en forma gratuita. Para acceder a asignaciones calificadas y obtener un certificado, deberás comprar la experiencia de Certificado, ya sea durante o después de participar como oyente. Si no ves la opción de oyente:
- es posible que el curso no ofrezca la opción de participar como oyente. En cambio, puedes intentar con una Prueba gratis o postularte para recibir ayuda económica.
- Es posible que el curso ofrezca la opción 'Curso completo, sin certificado'. Esta opción te permite ver todos los materiales del curso, enviar las evaluaciones requeridas y obtener una calificación final. También significa que no podrás comprar una experiencia de Certificado.
¿Qué recibiré si me suscribo a este Programa especializado?
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