Acerca de este Curso

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Resultados profesionales del estudiante

50%

comenzó una nueva carrera después de completar estos cursos

43%

consiguió un beneficio tangible en su carrera profesional gracias a este curso

20%

consiguió un aumento de sueldo o ascenso
Certificado para compartir
Obtén un certificado al finalizar
100 % en línea
Comienza de inmediato y aprende a tu propio ritmo.
Fechas límite flexibles
Restablece las fechas límite en función de tus horarios.
Aprox. 12 horas para completar
Inglés (English)
Subtítulos: Inglés (English)

Habilidades que obtendrás

BioinformaticsSamtoolsUnixCommand-Line Interface

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ofrecido por

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Universidad Johns Hopkins

Programa - Qué aprenderás en este curso

Calificación del contenidoThumbs Up87%(1,622 calificaciones)Info
Semana
1

Semana 1

3 horas para completar

Basic Unix Commands

3 horas para completar
12 videos (Total 105 minutos), 5 lecturas, 2 cuestionarios
12 videos
Basic Unix Commands 2: Files, Directories, Paths7m
Basic Unix Commands 3: File Naming4m
Basic Unix Commands 4: Content Creation9m
Basic Unix Commands 5: Accessing Content I6m
Basic Unix Commands 6: Accessing Content II4m
Basic Unix Commands 7: Redirecting Content6m
Basic Unix Commands 8: Querying Content15m
Basic Unix Commands 9: Comparing Content11m
Basic Unix Commands 10: Archiving Content13m
Basic Unix Commands 11: Practical Exercises I13m
Basic Unix Commands 12: Practical Exercises II9m
5 lecturas
Welcome Message10m
Syllabus10m
VMBox Download & Instructions10m
Pre-Course Survey10m
Module 1 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2 ejercicios de práctica
Module 1 Quiz20m
Module 1 Exam34m
Semana
2

Semana 2

3 horas para completar

Week Two

3 horas para completar
11 videos (Total 127 minutos), 1 lectura, 2 cuestionarios
11 videos
Sequences and Genomic Features 2: Sequence Representation and Generation11m
Sequences and Genomic Features 3: Annotation14m
Sequences and Genomic Features 4.1: Alignment I13m
Sequences and Genomic Features 4.2: Alignment II9m
Sequences and Genomic Features 5: Recreating Sequences & Features12m
Sequences and Genomic Features 6: Genomic Feature Retrieval5m
Sequences and Genomic Features 7: SAMtools I11m
Sequences and Genomic Features 8: SAMtools II9m
Sequences and Genomic Features 9: BEDtools I15m
Sequences and Genomic Features 10: BEDtools II15m
1 lectura
Module 2 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2 ejercicios de práctica
Module 2 Quiz20m
Module 2 Exam40m
Semana
3

Semana 3

2 horas para completar

Week Three

2 horas para completar
8 videos (Total 55 minutos), 1 lectura, 2 cuestionarios
8 videos
Alignment & Sequence Variation 2: Alignment & Variant Detection Tools5m
Alignment & Sequence Variation 3: VCF11m
Alignment & Sequence Variation 4: Bowtie9m
Alignment & Sequence Variation 5: BWA 4m
Alignment & Sequence Variation 6: SAMtools (mpileup)6m
Alignment & Sequence Variation 7: BCFtools8m
Alignment & Sequence Variation 8: Variant Calling5m
1 lectura
Module 3 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
2 ejercicios de práctica
Module 3 Quiz20m
Module 3 Exam48m
Semana
4

Semana 4

3 horas para completar

Week Four

3 horas para completar
8 videos (Total 75 minutos), 2 lecturas, 2 cuestionarios
8 videos
Tools for Transcriptomics 2: RNA-seq7m
Tools for Transcriptomics 3.1: Tophat I9m
Tools for Transcriptomics 3.2: Tophat II 8m
Tools for Transcriptomics 4: Cufflinks10m
Tools for Transcriptomics 5: Cuffdiff16m
Tools for Transcriptomics 6.1: Integrated Genomics Viewer I8m
Tools for Transcriptomics 6.2: Integrated Genomics Viewer II 6m
2 lecturas
Module 4 Exam Instructions **IMPORTANT**10m
Post-Course Survey10m
2 ejercicios de práctica
Module 4 Quiz20m
Module 4 Exam1h 10m

Revisiones

Principales revisiones sobre COMMAND LINE TOOLS FOR GENOMIC DATA SCIENCE

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Acerca de Programa especializado: Genomic Data Science

With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome. This Specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, along with a variety of software implementation tools like Python, R, Bioconductor, and Galaxy. This Specialization is designed to serve as both a standalone introduction to genomic data science or as a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics, for scientists in these fields seeking to gain familiarity in data science and statistical tools to better interact with the data in their everyday work. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit. Please note that you will not receive a Certificate of Completion if you choose to Audit....
Genomic Data Science

Preguntas Frecuentes

  • Access to lectures and assignments depends on your type of enrollment. If you take a course in audit mode, you will be able to see most course materials for free. To access graded assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience, during or after your audit. If you don't see the audit option:

    • The course may not offer an audit option. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid.
    • The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.
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